扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序，分析序列中的变异。16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA，选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目标区域，通过检测目标区域的序列变异和丰度，以研究环境微生物多样性及群落组成差异。
技术优势
1、通量高，适用于大量样本的特定基因组区域研究
2、周期短，可缩短研究周期，加速临床应用及文章发表
3、信息度高，针对感兴趣的基因组区域进行遗传变异位点的寻找，可对特定区域进行深入研究
实验路线
样品准备→DNA提取与检测→PCR扩增→产物纯化→文库制备与产检→Hiseq上机测序
生物信息学分析
应用领域
环境微生物、肠道微生物、发酵微生物菌群研究等
样品要求
| 样品类型 | 样品量 | 样品要求 | |
| 常见环境样本 | 土壤、淤泥、沉积物 | ≥3g | 建议使用5ml EP 管进行装载 |
| 粪便 | ≥500mg | 详情咨询 | |
| 水样（过滤后的滤膜拭子） | ≥2个 | 最适滤膜直径3-4cm，孔径大小一般选择0.22um或者0.45um | |
| 组织样本 | 肠道组织等 | ≥1g | 详情咨询 |
| DNA/PCR产物 | DNA（浓度≥5ng/ul） | ≥150ng | DNA要有明显主带，无降解，无RNA、蛋白质等杂质污染 |
| PCR产物（浓度≥20ng/ul） | ≥400ng | 片段大小＜450bp，条带单一，无降解，无引物二聚体 | |