主要是以标准品为参照，对特定的代谢物群进行有针对性地、特异性地检测与分析。相对于全代谢组分析而言，靶向代谢组分析具有特异性强，检测灵敏度高和定量准确等几个特点,主要包括LC-MS靶标代谢组学/GC-MS靶标代谢组学。

技术流程

规范取样→样品冻干→样品提取→上机跑样检测→下机数据分析

应用领域

验证由发现代谢组学实验提出的假说
进行基于假说的探索性实验（通常根据最新的解释），针对特定代谢物，研究代谢模型