服务简介
蛋白质的糖基化修饰是在酶的控制下,蛋白质或脂质附加上糖类的过程,发生于内质网。在糖基转移酶作用下将糖转移至蛋白质,和蛋白质上的氨基酸残基形成糖苷键。蛋白质经过糖基化作用,形成糖蛋白。糖基化对蛋白质具有重要的修饰作用,有调节蛋白质功能作用。糖基化蛋白质组以组织、细胞等较为复杂样本为研究对象,目的在于鉴定样品中发生糖基化修饰的蛋白质以及相应的糖基化修饰位点。
技术特点
采用主流凝集素亲和法富集N-糖基化肽段,特异性高,富集效率好;
通过高分辨率、高扫描速度的质谱,对富集的糖基化化肽段进行大规模鉴定;
结合常用的定量技术可对不同样品间的糖基化水平差异进行定量比较。
适用范围
药物作用靶点研究;
疾病标志物筛选;
植物胁迫/抗逆研究;
作用机制研究;
要求物种具有蛋白质参考数据库、EST序列(转录组)或基因组注释信息。
服务流程
蛋白提取→ 肽段酶解→ N-糖基化富集→ HPLC分离→ LC-MS/MS→ 数据解析→ 结果交付
客户提供
需鉴定的样品;
样品信息单:需详细填写样品来源、含量、状态及其他基本信息。
最终交付
实验报告一份,含具体实验流程及蛋白质组鉴定及定量结果(生物信息学分析)。
生物信息学分析内容包括:
修饰蛋白、修饰位点鉴定;
鉴定结果特征分布:肽段长度、蛋白覆盖度分布、unique肽段分布;
修饰位点motif预测;
蛋白质GO功能分类、COG注释、Pathway通路注释;
蛋白质网络互作预测(高级分析);
蛋白质Domain预测(高级分析);
蛋白质亚细胞定位(高级分析)。
服务周期
自送样起40-60个工作日。