非靶向代谢组学又称为发现代谢组学，主要是将对照组和实验组的代谢组（某一生物体的全 部代谢物）进行比对，以找出其代谢物的差异，主要分为医学代谢组学、植物代谢）组学、微生物代谢组学、药物代谢组学及脂质代谢组学。

 
技术流程
采样→代谢物的提取→上机检测（GC-MS、LC-MS、NMR）→数据预处理（信息峰提取、识别）→多元变量统计分析（PCA、PLS-DA、OPLS-DA）→深度数据挖掘（代谢通路分析，关联分析）

数据分析内容
基本数据分析
数据预处理

PCA分析

PLS-DA分析

OPLS-DA分析

差异化合物筛选

差异化合物鉴定

高级数据分析

多组分关联分析（同一标本同时取多组分）

代谢通路分析

代谢网络分析

多组学数据关联分析（具备多组学数据）

应用领域

差异代谢物寻找筛选、疾病发病机制研究、药物治疗机制研究。